CENTRO DE TRANSPORTES DE MERCANCIAS DE SEVILLA, S.A. es una sociedad anónima creada en 1.990 a partir del Decreto 144/1.990, de 15 de mayo, por el que se autorizaba a la Empresa Pública de Suelo de Andalucía (EPSA) a participar en la constitución de aquélla, junto con la Sociedad para la Promoción y Reconversión Económica de Andalucía, S.A. (SOPREA) y Almacenes, Depósitos y Estaciones Aduaneras, S.A. (ALDEASA), en una proporción del 40%, 40% y 20% respectivamente.
En octubre de 1.992, la Empresa Pública de Suelo de Andalucía (EPSA), compra las acciones de ALDEASA, por lo que, a partir de ese momento, EPSA tiene el 60% de las acciones del CTMS y SOPREA el 40% restante.
En octubre de 1.996, la Junta de Andalucía, en virtud de lo acordado en el Decreto 130/1.996, de 2 de abril, por el que se autoriza la adquisición por la Comunidad Autónoma de Andalucía, de todas las acciones de la entidad Centro de Transporte de Mercancías de Sevilla, S.A., compra el 100% de las acciones del CTMS, por lo que se convierte en accionista único, representado por la Dirección General de Patrimonio.